Mais d’où vient cette expression ?

Il semblerait que cette expression provienne d’une confusion ou d’un jeu de mots entre les mots matou (synonyme familier de chat) et maton.

Dans l’Est de la France, le mot maton désignait le lait caillé ou le lait en grumeaux. Ce mot a ensuite désigné une accumulation de poils, un amas de laine susceptible de boucher un conduit. Avec ce dernier sens, on se rapproche de l’expression avoir un chat dans la gorge : être enroué implique la présence de glaires, semblables à un maton (appelé donc matou par confusion ou jeu de mots, puis chat), qui obstruent le conduit vocal.